总医院内分泌科于2006年3月独立，包括内分泌、干部保健2部分共20张床位。设有内分泌普通门诊、专家门诊和实验室；现拥有高级专业技术人员2名，中级专业技术人员6名。 邹城市唯一内分泌专科中心，济宁市三级医院中率先开展动态血糖监测。主要承担内分泌代谢病的医疗、保健、科研和教学任务。
医疗特色
1．内分泌专科综合诊断治疗水平高，位于济宁市领先行列。
2．在糖尿病、脑垂体、甲状腺、甲状旁腺、胰腺、肾上腺、性腺、骨代谢等内分泌代谢病的诊治、护理等方面在内外具有较大的优势和特色。收治病人来自全省各地，数量多，病种复杂。如原醛、各种代谢性骨病的病因诊断以及原发性高钠血症等。2006年以来，年门诊人数超过3万人次, 每年收治600多病人,平均住院天数12.7天。
3．危重病人抢救成功率高
糖尿病酮症酸中毒、非酮症高渗性糖尿病昏迷、严重低血糖症、抗甲状腺药物引起的急性粒细胞缺乏、严重低钠血症等的抢救成功率高，历年统计抢救成功率均在90%以上。
4．糖尿病综合防治工作卓有成效
在糖尿病综合防治上，对糖尿病早期诊断和防治有了成熟的经验，有专人负责开展糖尿病患者教育,包括门诊、病房和出院后教育。积极开展老年人的糖尿病早期诊断、糖耐量受损早期干预药物防治、糖尿病慢性并发症综合防治、胰岛素泵及动态血糖仪等先进仪器引进使用等。
5．护理工作规范科学
建立、健全了各项规章制度，专科护理工作制度化、规范化和科学化。
6．内分泌专科实验室所开展项目：
（1）磁酶分析内分泌激素测定仪
（2）动态血糖检测仪
（3）糖化血红蛋白测定
（4）尿微量蛋白测定
（5）C-反应蛋白测定
（6）糖尿病早期神经病变测定
（7）糖尿病足特色治疗
（8）糖尿病的强化治疗
在邹城市区属一流水平，在济宁市内位于先进行列。