兖矿集团公司总医院职业病科创建于1988年，为医院医、教、研三位一体的重点科室。是全国煤炭基金会职业病定点收治医疗机构，也是兖矿集团公司唯一指定职业病收治机构。在职业病的诊治方面具有丰富的临床经验。同时收治呼吸消化系统疾病患者，开放床位达40张，年门诊量1万余人次，年收入住院患者1400余人次。已开展无痛胃镜、肠镜、气管镜项目，每年行无痛胃镜3000余例，共做约3万例。现有医护人员14名，其中正高职称1名，副高职称1名，中级职称7名。设有气管镜室、胃镜室、肠镜室，技术力量雄厚。医疗设备先进，配有多款无创呼吸机、有创呼吸机、富士能胃镜、奥林巴斯气管镜、富士能肠镜、C14呼气检测仪。在济宁地区具有很高的学术地位及影响力。尤其在胃肠道疾病、尘肺病、职业中毒、慢性阻塞性肺病、下呼吸道感染、呼吸衰竭、机械通气、肺癌的综合诊治和个体化治疗、睡眠呼吸障碍、呼吸康复、变态反应疾病和呼吸系统疑难病的诊治等方面居领先地位。学科带头人是胡爱民主任医师。